Гистопатологические паттерны роста (HGPs) печеночных метастазов колоректального рака (CLM) представляют важные прогностические и предиктивные биомаркеры. Десмопластический/инкапсулирующий паттерн (EHGP) ассоциирован с улучшенной выживаемостью после хирургического лечения, тогда как замещающий паттерн (RHGP) связан с худшими исходами. Однако HGPs могут быть надежно оценены только после операции, что ограничивает их использование в качестве предоперационных биомаркеров.
Для молекулярной характеристики HGPs была применена пространственная транскриптомика методом in situ sequencing (ISS) — метод картирования экспрессии РНК в тканях. Исследование проведено на ткани резецированных CLM от 19 пациентов, не получавших химиотерапию, с использованием двух кастомных панелей генов (150 и 175 генов).
Исследование выявило принципиально различные молекулярные программы для двух паттернов роста:
Замещающий паттерн (RHGP)
Характеризовался:
- Поврежденными SAA1+ гепатоцитами
- KRT18+ неопластическими клетками
- Бифункциональными гепатоцит-холангиоцитными клетками
Десмопластический паттерн (EHGP)
Отличался:
- Активацией интерферон-γ сигнального пути
- Инфильтрацией цитотоксическими Т-клетками
- Формированием фиброзной капсулы с зон-специфичными особенностями:
- Активация печеночных звездчатых клеток, ангиогенез и рекрутирование иммунных клеток со стороны печени
- Опухоль-ассоциированные фибробласты со стороны опухоли
Выявленные различия указывают на то, что паттерны роста формируются в результате взаимодействий между опухолью и организмом-хозяином. Полученные данные раскрывают новые молекулярные особенности метастатической ниши и могут информировать поиск инновационных терапевтических стратегий, включая подходы к стимулированию формирования благоприятного EHGP паттерна.