Аденоплоскоклеточная карцинома поджелудочной железы (ASQ) представляет собой редкий вариант опухоли с плохо определенными клиническими и молекулярными характеристиками по сравнению с обычной протоковой аденокарциномой поджелудочной железы (PDAC). Новое исследование Johns Hopkins продемонстрировало, что несмотря на общие геномные драйверы с PDAC, ASQ обладает транскрипционно различными особенностями с пространственно организованной опухолевой и иммунной гетерогенностью.
Исследователи ретроспективно оценили клинико-патологические характеристики, паттерны лечения и выживаемость пациентов с ASQ, получавших лечение в Johns Hopkins с 2013 по 2023 год (n=178). Геномные ландшафты ASQ (n=244) сравнивались с PDAC (n=29,021) с использованием базы данных FoundationCore. Хирургически резецированные опухоли ASQ (n=11 от 8 пациентов) анализировались с помощью пространственной транскриптомики Visium с сравнительным набором данных PDAC (n=4).
Клинические исходы
Пациенты с ASQ демонстрировали плохие исходы как при резецированном, так и при распространенном заболевании. Это подчеркивает агрессивную природу данного подтипа рака поджелудочной железы.
Геномный анализ
Анализ FoundationCore выявил:
- Аналогичную частоту мутаций KRAS по сравнению с PDAC
- Более высокую потерю MTAP
- Обогащение низкочастотными иммунными биомаркерами (MSI-high, PD-L1+, TMB ≥10 мутаций/Mb) в ASQ по сравнению с PDAC
Пространственная транскриптомика
Пространственный транскриптомный анализ показал:
- Широко схожие пропорции иммунных клеток между подтипами
- Более высокое содержание регуляторных T-клеток в ASQ в контексте скудного обнаружения в PDAC
- Различия в пространственных паттернах колокализации иммунных популяций между ASQ и PDAC
- В ASQ иммунные инфильтраты располагались ближе всего к плоскоклеточным регионам и дальше всего от железистых регионов
Молекулярные особенности
ASQ продемонстрировал:
- Повышенную экспрессию плоскоклеточных/базальных линий по сравнению с PDAC
- Обогащение внутриопухолевых плоскоклеточных регионов путями эпителиально-мезенхимального перехода, апикальных соединений, воспалительных и стрессовых ответов относительно железистой ниши
Результаты исследования поддерживают необходимость разработки подтип-специфических терапевтических стратегий для ASQ. Несмотря на общие геномные драйверы с PDAC, уникальные транскриптомные особенности и пространственная организация опухолевой и иммунной гетерогенности ASQ могут требовать различных подходов к лечению.
Обогащение низкочастотными иммунными биомаркерами в ASQ может указывать на потенциальную чувствительность к иммунотерапии у отдельных пациентов, что требует дальнейшего изучения в клинических испытаниях.