Исследование мутационного ландшафта рака молочной железы человека (HBC) выявило важную роль APOBEC3 (A3)-ассоциированного мутагенеза в патогенезе заболевания. Транскриптомная стратификация HBC по активности A3 показала сильную ассоциацию опухолей с A3-активностью с PAM50-HER2-обогащенным (HER2E) подтипом.
Ключевым открытием стала значительная корреляция между FGFR4 и экспрессией и ферментативной функцией APOBEC3A/B. Это указывает на потенциальную регуляторную связь между FGFR4 и A3, предоставляя новые инсайты в механизмы A3-опосредованного мутагенеза.
Сравнительный геномный анализ показал, что APOBEC3-ассоциированные мутации были широко распространены в HBC, но практически отсутствовали в опухолях молочных желез собак (CMT). Это различие обусловлено структурными особенностями белков A3 и более низкой базальной экспрессией, что делает CMT неподходящей моделью для изучения A3-опосредованного мутагенеза.
Результаты исследования предполагают, что активность FGFR4-A3 может рассматриваться наряду с другими молекулярными биомаркерами для классификации HER2E подтипа. Это открывает новые возможности для персонализированного подхода к лечению пациентов с HER2-обогащенным раком молочной железы и подчеркивает важность понимания мутационных процессов для разработки терапевтических стратегий.